История города Сан-Жозе-дус-Кампус уходит корнями в конец XVI века, когда на этой земле иезуитами было основано фермерское хозяйство. Однако официальной датой рождения города считается 27 июля 1767 года. В этот день поселение получило статус вилы (Vila de São José do Paraíba) и собственное муниципальное управление, что стало важным шагом в стратегии португальской администрации по развитию региона. Первоначально иезуиты использовали эти земли для защиты коренного населения от охотников за рабами, но после их изгнания из Бразилии в 1759 году поселение стало развиваться как небольшой сельскохозяйственный центр.
Ключевым фактором становления города стало его стратегическое расположение в плодородной долине реки Параиба, между двумя главными мегаполисами страны — Сан-Паулу и Рио-де-Жанейро. Это способствовало его аграрному росту. В XIX веке экономика города процветала благодаря выращиванию хлопка, который экспортировался в Англию, а также производству кофе. В первой половине XX века город приобрёл новую известность как национальный центр лечения туберкулёза благодаря своему благоприятному климату, что привело к открытию множества санаториев.
Ранняя культурная и экономическая жизнь была тесно связана с сельским хозяйством. Скромное поселение постепенно превращалось в важный аграрный центр. Именно «санаторный период» привнёс в город новую социальную динамику и подготовил инфраструктурную базу для будущего промышленного и технологического рывка, который начался в середине XX века и навсегда изменил облик Сан-Жозе-дус-Кампус, превратив его в один из ведущих технологических хабов Латинской Америки.