История поселения Мануэль Б. Гоннет неразрывно связана с масштабным проектом основания города Ла-Плата в конце XIX века. Импульсом к развитию этой территории послужила прокладка железнодорожной линии, соединившей Буэнос-Айрес с новой столицей провинции. Ключевой точкой отсчета принято считать открытие здесь железнодорожной станции в 1889 году, вокруг которой постепенно начал формироваться населенный пункт.
Важно отметить, что свое нынешнее имя местность получила не сразу. Изначально поселение развивалось вокруг транспортного узла, и лишь позже станция и район были названы в честь доктора Мануэля Бернардо Гоннета. Этот выдающийся законодатель и первый министр общественных работ провинции Буэнос-Айрес сыграл значительную роль в регионе, поэтому присвоение его имени стало знаком признания его заслуг.
Превращение разрозненных земель в оживленный район было обусловлено удачной географией и транспортной доступностью. Близость к Ла-Плате сделала эту территорию естественным вектором расширения жилой зоны, а активная поддержка урбанизации со стороны правительства провинции ускорила процесс заселения окрестностей нового административного центра.
В начале своего пути Мануэль Б. Гоннет формировался как тихий, зеленый пригород. Экономическая жизнь базировалась на садах и молочных фермах, снабжавших столицу, а культурный облик определялся статусом престижной зоны отдыха. Здесь активно строились «кинтас» — загородные усадьбы состоятельных жителей, которые приезжали сюда на выходные ради свежего воздуха, что заложило основу для репутации района как уютного и спокойного места для жизни.