Александриядағы Грек-рим мұражайының 1892 жылдан басталатын бай тарихы бар. Оның негізі қаланың ауқатты тұрғындарының жомарт қайырымдылығының арқасында қаланды, олар Александрия мен оның айналасындағы археологиялық қазба жұмыстары кезінде табылған бірегей грек-рим жәдігерлерін сақтап қалуға және көрсетуге тырысты. Бастапқыда мұражай Rosset көшесінде (қазіргі Sharia El Horreya) бір қабатты ғимараттың бес бөлмесінде ғана қарапайым түрде орналасқан болатын. Алайда коллекция тез өсіп, 1895 жылы 17 қазанда мұражайдың жаңа, кеңірек ғимаратта ресми ашылуы өтті, онда экспонаттар он бір залды иеленді.
Мұражайды құрудың бастамашысы және оның алғашқы директоры итальяндық Джузеппе Ботти болды. Оның басты мақсаты — Александриядағы құрылыс және археологиялық жұмыстар кезінде көптеп табылған баға жетпес көне жәдігерлердің сыртқа шығарылуына және жойылуына жол бермеу еді. Директорлық қызметті атқарған Эваристо Бреччамен бірге олар Мысырдағы грек-рим кезеңінің ең маңызды коллекцияларының бірінің негізін қалады. Археологиялық зерттеулер кеңейіп, табылған заттар саны артқан сайын мұражай коллекциясы үнемі толығып отырды және уақыт өте келе экспозиция 23 залға дейін ұлғайды, олардың әрқайсысы осы таңғажайып кезең тарихының өз тарауын баяндады.
1996 жылы мұражай ғимараты Мысыр мемлекетінің меншігіне өтті, ал 2003 жылғы 31 тамызда Мысырдың Ежелгі жәдігерлер жөніндегі жоғарғы кеңесінің патронажымен оның салтанатты ашылуы өтті. Алайда екі жылдан кейін, 2005 жылы, ғимараттың ескіруіне байланысты ауқымды реконструкция жүргізу қажеттілігінен мұражай келушілер үшін есігін жабуға мәжбүр болды. Реставрация процесі қаржыландыру мәселелеріне байланысты ұзақ әрі күрделі болып, жиырма жылға жуық уақытқа созылды. Жұмыстар басталғаннан кейін он жыл өткен соң ғана жаңа күшпен қайта жанданды.
Ақырында, ұзақ күтуден және реставраторлардың тынымсыз жұмысынан кейін, 2023 жылдың қазан айында Грек-рим мұражайы жұртшылық үшін қайтадан есігін ашты. Жаңартылған және жаңғыртылған мұражай әлемнің түкпір-түкпірінен келген келушілерді Мысыр жерінен табылған грек-рим дәуірінің баға жетпес қазыналарымен таныстыруға дайын. Бұл оқиға тарих пен мәдениеттің барлық сүйер қауымы үшін нағыз мерекеге айналды.