Город Эль-Обейд был основан в 1821 году во времена Османского Египта. Благодаря своему стратегическому расположению примерно в 370 км к юго-западу от Хартума, он быстро превратился в важный торговый узел на пересечении караванных путей. Это способствовало его стремительному росту и превращению в один из ключевых центров региона.
Значимость Эль-Обейда определялась несколькими основными факторами. Прежде всего, город стал крупнейшим в мире рынком гуммиарабика — ценной смолы, добываемой из местных акаций, что привлекало в регион торговцев и способствовало его экономическому процветанию. Важную роль играла и транспортная доступность: Эль-Обейд сначала служил перекрестком для караванов, а позже стал конечной станцией железной дороги и узлом шоссейных дорог, связывающих различные части Судана.
Помимо торгового и экономического значения, город сыграл заметную роль и в политической истории страны. Во время восстания Махди в 1883 году Эль-Обейд был захвачен повстанцами после крупного сражения и на некоторое время стал их штаб-квартирой. Это событие подчеркнуло стратегическую важность города в Судане XIX века.
С самого начала Эль-Обейд развивался не только как центр торговли, но и как сердце крупного скотоводческого района. Культурно он представлял собой плавильный котел, где встречались представители различных племен и народов, привлеченные его экономическими возможностями. Это способствовало формированию уникальной и многообразной атмосферы, которая характерна для крупных торговых центров региона.