История Сьюдад-Хуареса — это история города, рожденного на пересечении путей и культур. Его становление неразрывно связано с географическим положением на берегу реки Рио-Гранде и ключевыми событиями в истории Северной Америки.
Город был основан в 1659 году испанскими исследователями под предводительством монаха-францисканца Фрая Гарсии де Сан-Франсиско. Изначально он получил название Эль-Пасо-дель-Норте (El Paso del Norte), что в переводе означает «Северный проход». Это имя отражало его стратегическое значение как удобного места для пересечения реки и дальнейшего продвижения на север. Поселение возникло как миссия Нуэстра-Сеньора-де-Гуадалупе и служило важным форпостом на знаменитом королевском пути Камино-Реаль-де-Тьерра-Адентро, соединявшем Мехико с северными территориями.
Развитие города определили несколько факторов. Его расположение в естественном «проходе» между двумя горными хребтами сделало его воротами для путешественников и торговцев. Являясь важным пунктом на пути Камино-Реаль, Эль-Пасо-дель-Норте быстро превратился в оживленный торговый центр. После Американо-мексиканской войны по договору Гвадалупе-Идальго в 1848 году река Рио-Гранде стала официальной границей между Мексикой и США. Это разделило историческое поселение на две части: мексиканский Пасо-дель-Норте и американский Эль-Пасо. В 1888 году мексиканская часть города была переименована в Сьюдад-Хуарес в честь национального героя и президента Мексики Бенито Хуареса.
С самого начала экономика Эль-Пасо-дель-Норте была основана на сельском хозяйстве, особенно славились местные виноградники, продукция которых ценилась по всему региону. Культурная жизнь формировалась под влиянием испанских колониальных традиций, которые тесно переплетались с обычаями коренных индейских племен. Поселение было не только военным и торговым, но и религиозным центром, что подтверждает основание миссии францисканцами.