Тарихи порттың қақ ортасында орналасқан Себу-Сити, Филиппин ұлттық мұражайы – Себу аймақтың мәдени және археологиялық кодының басты сақтаушысы болып табылады. Мұражай 1910 жылы салынған зәулім Aduana (бұрынғы кеден ғимараты) ғимаратында орналасқан. Неоклассицизм стиліндегі бұл сәулет қазынасы Филиппин әлемдік экономикаға белсенді түрде кіріге бастаған теңіз саудасының қарқынны даму кезеңін еске сала отырып, өздігінен маңызды экспонат қызметін атқарады.

Саяхатшылардың фотосуреттері:
Мұражай экспозициясы көне тарих пен бүгінгі күнді шебер ұштастырады. Бес кең галереяда бірегей жәдігерлер ұсынылған: себуано халқының тұрмыс-тіршілігі туралы баяндайтын этнографиялық олжалардан бастап, теңіз түбінен шығарылған қазыналарға дейін. 1600 жылы батып кеткен аңызға айналған испандық «Сан-Диего» галеонының заттар коллекциясы ерекше орын алады. Мұражай жай ғана көне жәдігерлерді көрсетіп қоймайды, ол ғасырлар бойы Шығыс пен Батыс арасындағы көпір болған аралдың тірі тарихын баяндайды.
Мұражай кешенінің ең ерекше бөлшектерінің бірі — «Даналық, махаббат және сәттілік құдығы» деп аталатын нысан. Бұл тарихи су көзі испандық отарлау кезеңінен бері сақталған және бүгінде аңызға толы. Келушілер мұнда тек білім алу үшін ғана емес, сонымен қатар ұлттық жәдігерлердің мекеніне айналғанға дейін кеден де, президенттік резиденция да болып үлгерген осы ескі ғимарат сыйлайтын ерекше тыныштық атмосферасы үшін келеді.