Бандар-Сери-Бегаван тарихы әлемдегі осындай ең ірі елді мекендердің бірі болып саналатын әйгілі «судағы ауыл» — Кампонг-Айермен тығыз байланысты. Қытай және араб дереккөздеріндегі Бруней өзеніндегі елді мекен туралы алғашқы мәліметтер VI-VII ғасырларға жатады, бұл оның көне тегін көрсетеді. Ғасырлар бойы дәл осы Кампонг-Айер «Шығыс Венециясы» деген атқа ие болып, сұлтанаттың нақты орталығы мен жүрегі болды. Біз бүгін білетін құрлықтағы қала тек XX ғасырда ғана белсенді дами бастады. 1970 жылғы 5 қазанға дейін қала Бруней-Таун (немесе Бандар-Бруней) деп аталды, содан кейін ол тақтан бас тартқаннан кейін «Сери Бегаван» лауазымын алған билеуші Сұлтанның әкесінің құрметіне өзгертілді.
Қаланың дамуы бірнеше стратегиялық артықшылықтарға байланысты болды. Оның Бруней өзенінің сағасындағы географиялық орналасуы Оңтүстік Қытай теңізіне ыңғайлы шығуды қамтамасыз етіп, қаланы маңызды теңіз және сауда торабына айналдырды, ал өзен қауіпсіз айлақ және көлік артериясы қызметін атқарды. Ғасырлар бойы Бандар-Сери-Бегаван жанданған сауда орталығы болды, онда жергілікті көпестер Қытайдан, Үндістаннан және араб елдерінен келген саудагерлермен кәфүр, бұрыш және басқа да тауарларды алмастырды. Сонымен қатар, құдіретті Бруней сұлтанатының астанасы ретінде қала аймақтың саяси, діни және әкімшілік өмірінің орталығы болды, онда Сұлтанның резиденциясы мен басты мемлекеттік мекемелер орналасты.
Қаланың ерте өмірі су бетінде шоғырланды. Мәдениет пен экономика үйлер қадаларға салынып, ағаш көпірлермен жалғанған Кампонг-Айердің ерекше өмір салтының айналасында қалыптасты. Экономиканың негізі балық аулау, кеме жасау және қолөнер (мысалы, күміс бұйымдар жасау және тоқымашылық) болды. Мәдени тұрғыдан қала малай дәстүрлері мен исламның күшті әсерімен дамыды, бұл сәулетте, әдет-ғұрыптарда және қоғамдағы Сұлтанның орталық рөлінде көрініс тапты.