Таллахасси тарихы оның ресми іргетасы қаланғанға дейінгі ғасырлар қойнауына кетеді. Қаланың атауы апалачи үндістерінің тілінен шыққан және «ескі танаптар» немесе «ескі қала» дегенді білдіреді. Бұл жерлерді еуропалықтар келгенге дейін мыңдаған жылдар бұрын жергілікті халықтар мекендеген, олардың алғашқысы XVI ғасырда испан конкистадоры Эрнандо де Сото болды.
Қала ресми түрде 1824 жылы таза саяси және географиялық себептермен құрылған. АҚШ Флориданы бақылауына алғаннан кейін, бұрынғы испан колониялары — Батыс және Шығыс Флорида үшін ортақ астана қажеттілігі туындады. Таллахасси олардың әкімшілік орталықтары Пенсакола мен Сент-Огастин қалаларының дәл ортасында орналасқандықтан, ымыралы шешім ретінде таңдалды. Ол кезде олардың арасындағы саяхат ұзақ әрі қиын болатын, бұл жаңа астананың орталықта орналасуын стратегиялық тұрғыдан дұрыс етті. Таллахассидің штат астанасы мәртебесі 1845 жылы Флорида АҚШ құрамына кірген кезде біржола бекітілді.
Қаланың қалыптасуын бірнеше негізгі факторлар айқындады. Негізі қаланған сәттен бастап алынған саяси мәртебе Таллахассиді мемлекеттік және заң шығарушы органдардың шоғырланған жеріне айналдырды, бұл оның алдағы ондаған жылдардағы даму бағытын белгілеп берді. Флориданың солтүстік бөлігінің орталығындағы географиялық орналасуы да бұған ықпал етіп, ыңғайлы байланыстарды қамтамасыз етті және өсуге септігін тигізді. Сонымен қатар, XIX ғасырда Таллахасси «Мақта белдеуінің» маңызды орталығы рөлін атқарды. Оның сауда және логистикалық позицияларын нығайту үшін 1830-шы жылдары аймақтағы алғашқы теміржолдардың бірі салынып, мақта экспорттау үшін қаланы Сент-Маркс портымен байланыстырды.
Ертедегі Таллахасси экономикасы мақта өсірумен және ауыл шаруашылығымен тығыз байланысты болды. Қала айналадағы плантациялар үшін сауда және қаржы торабы ретінде қызмет етті. Мәдени орта үндістер мұрасының, сондай-ақ испан, француз және ағылшын қоныстанушыларының дәстүрлерінің аралас әсерімен қалыптасты. 1851 жылы Флорида штатының университетінің және 1887 жылы Флорида ауыл шаруашылығы университетінің негізі қалануы Таллахассидің білім беру орталығы ретінде қалыптасуындағы ең маңызды қадам болды.