История возникновения Ойона тесно переплетена с суровой и величественной природой Анд. Первые поселения на этой территории появились задолго до прихода европейцев. Высокогорные долины современного Перу были обжиты доинкскими культурами, которые занимались здесь высокогорным земледелием и разведением ламовых.
Ключевым фактором становления Ойона стала его география. Расположенный в стратегически важном месте, город служил естественным связующим звеном между прибрежными территориями и глубоким высокогорьем. В эпоху империи Инков регион приобрел особое значение как важный пункт на пути следования караванов и центр добычи полезных ископаемых, которые высоко ценились древними правителями.
Современный Ойон начал приобретать свои очертания в колониальный период, когда испанские поселенцы обратили внимание на богатейшие залежи угля и минералов. С этого момента экономическая жизнь города стала вращаться вокруг горного дела. Ранняя культура города сформировалась на стыке древних андских традиций и испанского влияния, что до сих пор прослеживается в быту и обычаях местных жителей.