В отличие от большинства мировых столиц с многовековой историей, Нгерулмуд возник не стихийно, а как результат тщательно спланированного политического решения. Его появление в Палау было закреплено в Конституции страны еще в 1979 году. Основной целью создания нового административного центра на острове Бабелтуап было стремление властей распределить экономическую активность более равномерно, разгрузив прежний центр — Корор.
Место для будущей столицы было выбрано в штате Мелекеок. До начала масштабных работ здесь находилась лишь крошечная деревня, не имевшая стратегического или культурного значения. Географический фактор стал решающим: правительству требовалось пространство для строительства современного правительственного комплекса на самом крупном острове архипелага, чтобы стимулировать его освоение.
Процесс становления города был неразрывно связан с международным сотрудничеством. Проектирование началось в 1986 году, а активная фаза строительства пришлась на начало 2000-х годов. Благодаря значительным иностранным инвестициям и четкому архитектурному плану, Нгерулмуд превратился из смелой идеи в реальный символ суверенитета республики. Официально статус столицы был подтвержден 7 октября 2006 года.