В отличие от многих колониальных городов Мексики, Пуэрто-Эскондидо не был крупным центром в доиспанский период. Эта территория населялась коренными народами, но долгое время здесь не существовало постоянного поселения, главным образом из-за отсутствия надежных источников пресной воды. Название города, которое переводится как «Спрятанный порт», овеяно известной легендой XVI века. Считается, что оно связано с пиратом Эндрю Дрейком и похищенной им девушкой из местного племени, которая сумела сбежать и укрыться в густых лесах бухты. Пираты, безуспешно искавшие беглянку, стали называть это место «La Escondida» (Спрятанная), что со временем трансформировалось в современное название.
Развитие Пуэрто-Эскондидо из дикой бухты в населенный пункт было продиктовано спецификой географии и торговли:
- Кофейный экспорт: В начале XX века город начал играть важную роль как порт для вывоза кофе. Богатый урожай с плантаций в горах Оахаки спускали к побережью для отправки морем, так как сухопутных дорог практически не было.
- Естественная гавань: Глубокая и защищенная бухта позволяла торговым судам безопасно подходить близко к берегу, что сделало это место ключевым логистическим узлом региона.
- Административное деление: Исторически и политически территория города разделена между двумя муниципалитетами — Сан-Педро-Микстепек и Санта-Мария-Колотепек, что влияло на особенности управления и застройки.
До начала туристического бума экономика Пуэрто-Эскондидо базировалась исключительно на рыболовстве и обслуживании грузовых судов. Это был тихий поселок, где жизнь текла размеренно, подчиняясь сезонам сбора кофе и морским приливам. Местная культура формировалась в изоляции от крупных центров, сохраняя аутентичность рыбацкого быта. Кардинальные перемены начались лишь во второй половине XX века с появлением инфраструктуры водоснабжения и строительством шоссе. Вскоре после этого уникальные волны пляжа Зикатела привлекли первых серферов, что навсегда изменило экономический вектор развития города.