История Пасу-Фунду тесно связана с эпохой освоения южных земель Бразилии. Своё название, которое переводится как «Глубокий брод», местность получила благодаря реке, которую погонщикам скота (тропейрос) приходилось пересекать вброд. Первые поселения на этих землях, исконно населённых индейскими племенами кайнганг и гуарани, начали появляться в 1820-х годах. Официальной датой основания города считается 7 августа 1857 года, когда он был административно выделен в самостоятельный муниципалитет.
Стремительному росту города способствовало несколько ключевых факторов. Его географическое положение на пересечении важных маршрутов погонщиков скота сделало его стратегическим пунктом для отдыха и торговли, что привлекало всё больше поселенцев. Получение статуса муниципалитета в 1857 году дало мощный толчок к административному и социальному развитию, позволив сформировать местные органы власти. Экономически город также быстро развивался: изначально основу составляли скотоводство и выращивание йерба-мате, но со временем, благодаря плодородным землям, Пасу-Фунду превратился в один из ключевых аграрных центров региона, известный выращиванием пшеницы и сои.
С самого начала Пасу-Фунду формировался как многонациональный город. Помимо португальских переселенцев, значительный вклад в его развитие внесли иммигранты из Италии и Германии, которые привнесли свои культурные традиции и сельскохозяйственные ноу-хау. Это культурное разнообразие отразилось в архитектуре, кухне и обычаях горожан. Благодаря своему стратегическому положению и аграрному потенциалу, город быстро стал важным торговым узлом, где сходились интересы фермеров, скотоводов и ремесленников со всего региона.