Ямага тарихы қаланың қазіргі шекаралары қалыптасқанға дейінгі терең ежелгі дәуірден басталады. Археологиялық олжалар, соның ішінде айналадағы көптеген ежелгі қорғандар (кофун), Кикути өзенінің аңғарында адамдар қоныстанғанын және Жапонияның ерте тарихи кезеңдерінде-ақ маңызды билік орталығы болғанын айғақтайды. Жергілікті аңыздарға сүйенсек, осындағы әйгілі ыстық бұлақтар мың жылдан астам уақыт бұрын табылған, бұл қоныстанушылар мен зияратшылар үшін алғашқы тартылыс күшіне айналған.
Ямаганың шашыраңқы қоныстардан өркендеген сауда қаласына айналуы, әсіресе Эдо дәуірінде (1603–1868), стратегиялық орналасу мен табиғи ресурстардың сәтті үйлесуіне байланысты болды:
- Будзэн жолындағы пошта станциясы: Қала Кумамото қамалын Кюсю аралының солтүстік бөлігімен жалғайтын маңызды Будзэн Кайдо жолында орналасқан. Ямага даймё-феодалдары мен көпестері үшін негізгі демалыс орны қызметін атқарды.
- Өзен логистикасы: Кикути өзені басты көлік артериясы рөлін атқарды. Ол арқылы сол кездегі басты валюта — күріш Осака мен Эдоға одан әрі жөнелту үшін порттарға тасымалданды.
- Табиғи байлықтар: Геотермалдық бұлақтардың болуы денсаулығын түзеткісі келетін келушілердің тұрақты ағынын қамтамасыз етті, бұл қызмет көрсету саласы мен қонақ үйлердің дамуын ынталандырды.
Аймақтың экономикалық өркендеуі күріштің белсенді саудасына, сакэ және жібек құрты пілләларын өндіруге негізделді. Жергілікті көпестер жинаған капитал бай мәдени ортаны қалыптастыруға мүмкіндік берді, онда қағаз шамдар жасаудың бірегей қолөнері дүниеге келді. Бұл дәстүр жергілікті тұрғындар қалың тұманда алаулармен жол көрсеткен Кэйко императоры туралы ежелгі аңызға сүйенеді. Уақыт өте келе бұл ағаш пен металл қолданылмай, тек қағаз бен желімнен жасалатын әсем Ямага-торо шамдарын жасау өнеріне айналды, бұл қаланың мәдени мұрасының визит карточкасы болды.