Алжирдің ең көне қалаларының бірі болып табылатын Аннабаның тарихы ғасырлар қойнауына кетеді. Қаланың негізін б.з.б. XII ғасыр шамасында финикиялықтар Гиппон атты сауда бекетіө ретінде қалаған. Кейінірек ол Нумидия патшалығының астаналарының біріне айналды, сол үшін «Патшалық» — Hippo Regius деген құрметті қосымша атау алды. Дәл осы атпен ол әлемдік тарих жылнамасына соңғы антикалық дәуірдің ең маңызды орталықтарының бірі ретінде енді.
Қаланың қалыптасуының негізгі факторлары оның Жерорта теңізі жағалауындағы стратегиялық орналасуы және қолайлы табиғи айлағы болды. Бұл Гиппонды теңіз жолдары өтетін маңызды сауда торабына айналдырды. Алайда қалаға нағыз атақ-даңқты тек коммерциялық емес, сонымен қатар рухани бедел де әкелді. Б.з. IV-V ғасырларында мұнда христиан шіркеуінің әкелерінің бірі — Гиппон епископы Әулие Августин өмір сүріп, уағыз айтқан. Оның қызметі қаланы Рим империясының басты зияткерлік және діни орталықтарының біріне айналдырды.
Қаланың ерте экономикасы теңіз саудасымен және құнарлы маңайдағы ауыл шаруашылығымен тығыз байланысты болды. Рим құлағаннан кейін қала вандалдардың, византиялықтардың және арабтардың жаулап алуларын бастан өткерді. XI ғасырда антикалық Гиппон қирандыларынан сәл оқшау жерде «ююба (жеміс ағашы) қаласы» дегенді білдіретін Белеб-эль-Анаб атты жаңа қаланың негізі қаланды. Уақыт өте келе бұл атау қазіргі Аннаба атауына айналды. Колониалдық кезеңде Бон деген атпен танымал болған қала өзінің экономикалық маңызын бүгінгі күнге дейін сақтай отырып, қайтадан ірі портқа айналды.