История современного района Йылдырым неразрывно связана с эпохой становления Османской империи, когда город Бурса был её столицей. Хотя как административная единица Йылдырым был образован лишь в 1987 году, его исторические корни уходят вглубь XIV века.
Фактическое рождение поселения на этой территории связано с именем османского султана Баязида I, носившего прозвище «Йылдырым» (Yıldırım), что в переводе означает «Молниеносный». В конце XIV века, примерно в 1391–1395 годах, по его приказу здесь началось строительство грандиозного комплекса (кюллие). Этот комплекс стал ядром, вокруг которого со временем и разросся будущий район, унаследовавший имя своего основателя.
Ключевую роль в становлении района сыграло несколько факторов. Близость к Бурсе — первой крупной столице Османской империи — и прямое покровительство султана обеспечили быстрое развитие. Кроме того, Йылдырым занял стратегически важное положение на холмах к востоку от центра Бурсы, на склонах горы Улудаг, откуда открывался вид на всю столицу. Включение караван-сарая в состав первоначального комплекса указывает на то, что район был вовлечён в торговые пути того времени, ведь Бурса являлась важным центром на Великом шёлковом пути.
Изначально Йылдырым формировался как многофункциональный общественный центр. В состав комплекса Баязида входили не только мечеть и мавзолей, но и медресе (учебное заведение), больница (дарушшифа), общественная столовая (имарет) и бани. Это сделало его важным очагом религиозной, образовательной и социальной жизни. Экономика была тесно интегрирована с процветающей столичной жизнью Бурсы, известной своими рынками, ремёслами и, в особенности, производством шёлка.