История города Куэнка, расположенного в живописной долине в Андах, уходит корнями в доколумбову эпоху, задолго до прибытия европейцев. Этот город в Эквадоре является живым свидетельством смены великих культур и цивилизаций.
Задолго до испанского завоевания на месте современной Куэнки находилось процветающее поселение народа каньяри, основанное около 500 года н. э. и носившее имя Гуапонделег, что переводится как «равнина, большая как небо». В XV веке регион был завоёван инками, которые основали здесь крупный город Томебамба. По легендам, он должен был стать северной столицей их огромной империи и соперничать по великолепию с самим Куско. Однако город был разрушен в ходе междоусобной войны между наследниками инкского трона. На руинах древней Томебамбы конкистадор Хиль Рамирес Давалос официально основал испанский город Санта-Ана-де-лос-Куатро-Риос-де-Куэнка 12 апреля 1557 года.
Стремительному развитию города способствовало его удачное расположение в плодородной долине Анд на высоте около 2500 метров, в окружении четырех рек, что создало идеальные условия для сельского хозяйства. В колониальную эпоху Куэнка быстро стала важным административным, культурным и торговым центром региона. Город также прославился как центр ремесленного производства, а особую известность ему принесло изготовление шляп из соломы токилья, которые по ошибке получили всемирную известность как «панамы».
С самого начала своего существования Куэнка формировалась как оплот испанской колониальной культуры. В городе активно возводились церкви, монастыри и особняки, которые сегодня формируют его исторический центр, признанный объектом Всемирного наследия ЮНЕСКО. Благодаря богатому интеллектуальному и художественному наследию, а также множеству университетов и музеев, Куэнку часто называют «Афинами Эквадора». При этом свидетельства богатой доколумбовой истории не были утрачены: их можно увидеть в руинах инкского комплекса и в экспозициях Музея Пумапунго, расположенного на месте древнего города Пумапунго, что означает «Врата Пумы».